Op een noodlottige dag werd de hele mensheid versteend door een verblindende lichtflits. Na enkele millennia wordt middelbare scholier Taiju wakker en raakt verdwaald in een wereld van beelden. Hij is echter niet de enige! Zijn wetenschapsminnende vriend Senku is al een paar maanden actief en hij heeft een groots plan in gedachten: de beschaving een nieuwe impuls geven met de kracht van de wetenschap!
Door de geschiedenis heen hebben bepaalde beschavingen, gebeurtenissen en objecten ons gefascineerd en geïnspireerd om dieper te graven, hoger te klimmen en verder te gaan op onze eindeloze zoektocht om als eerste de waarheid te ontdekken. In deze 12-delige serie kijken we naar enkele van de meest iconische en blijvende mysteries die de wereld heeft gekend. We gaan terug naar het begin om te zien hoe mythen die door de tijd heen zijn doorgegeven, zijn uitgegroeid tot enkele van de grootste mysteries die we vandaag de dag kennen. Als we iets hebben geleerd, dan is het wel dat waar mysteries zijn, er altijd TRUTHSEEKERS zullen zijn, mensen die niets uit de weg gaan om de waarheid achter mythen en legenden te achterhalen en het onverbiddelijke licht van de waarheid in het verleden te werpen.
De toezichthoudende afdeling voor diagnostische pathologie van het Ten’ikai General Hospital behandelt gevallen die andere artsen te moeilijk vinden om te behandelen. Het is ook waar bizarre mysteries aan het licht komen, van onverklaarbare ziekten tot vreemde moorden die zelfs de politie niet kan oplossen. Centraal in dit alles staat Takao Ameku, een briljante arts die vastbesloten is de schokkende waarheid achter deze anomalieën te onthullen.