Nadat politieagent Daigo Agawa een groot incident heeft veroorzaakt, neemt hij zijn vrouw en dochter mee naar het afgelegen bergdorpje Kuge. Het lijkt de perfecte plek om bij te komen van de beproeving, ondanks de mysterieuze verdwijning van een vorige officier die daar was geplaatst. Op een dag wordt het lichaam van een oude vrouw op de berg gevonden. De familie Goto zegt dat ze is aangevallen door een beer, maar Daigo merkt een menselijke bijtvlek op. Al snel wordt duidelijk dat niet alles is wat het lijkt in het dorp.
Elk jaar worden in de VS ruim 600.000 mensen als vermist opgegeven. Van deze gemelde gevallen bestaat meer dan de helft van de vermiste mensen uit gekleurde mensen, die te gemakkelijk door het systeem worden verwaarloosd. Gabi Mosely, zelf een voormalige vermiste persoon, is nu gespecialiseerd in PR en leidt een crisismanagementteam dat deze vermiste mensen opspoort. Maar zonder dat iemand het weet, verbergt Mosely zelf een duister geheim.
Kobato besluit een eerlijke, nederige burger te worden na een bittere ervaring te hebben doorstaan die bekend staat als 'wijsheidswerk'. Hij sluit een pact met Osanai, zijn klasgenoot met hetzelfde doel, en ze zijn van plan om naar de middelbare school te gaan en een rustig leven te leiden. Maar om de een of andere reden blijven er onverklaarbare gebeurtenissen en rampen om hen heen gebeuren. Zullen Kobato en Osanai er ooit in slagen om een gewoon, vredig leven te leiden?
