Nadat middelbare scholier Jun Sakurada per ongeluk een wedstrijd had gewonnen voor het ontwerpen van een prinsessenjurk, werd hij zo belachelijk gemaakt door zijn klasgenoten dat hij niet meer naar school ging en zich vrijwel isoleerde van de buitenwereld; zijn zus Nori is vrijwel het enige contact dat hij nog heeft. In plaats daarvan heeft hij nu een vreemde hobby: hij bestelt online allerlei occulte of zogenaamd magische parafernalia, om ze kort voor het einde van de uitwisselingsperiode terug te sturen.
Nadat Satoru zijn moeder vermoord heeft aangetroffen, neemt Satoru's tijdreisvermogen hem 18 jaar mee in de tijd voor een kans om haar dood en die van drie klasgenoten te voorkomen.
Twee universiteitsstudenten komen een schijnbaar ongevaarlijk meisje tegen, Lucy genaamd, niet wetende dat ze eigenlijk een gemuteerde seriemoordenaar is met een gespleten persoonlijkheid.
Geconfronteerd met een existentiële dreiging die het Crime Lab zou kunnen neerhalen, moet een briljant team van forensische onderzoekers oude vrienden verwelkomen en nieuwe technieken inzetten om gerechtigheid in Sin City te behouden en te dienen.
Toen Yadomi Jinta een kind was, speelde hij een centrale rol in een groep goede vrienden. Na verloop van tijd dreven deze jeugdvrienden echter uit elkaar, en toen ze middelbare scholieren werden, beschouwden ze elkaar al lang niet meer als vrienden.
Een van de vriendinnen uit die groep, Honma Meiko, heeft nu een wens die ze aan Jinta vraagt te vervullen. Het probleem is dat ze zich niet meer kan herinneren wat haar wens is.
ChäoS;Child vindt plaats in oktober 2015, zes jaar na de gebeurtenissen van ChäoS;HEAd. In het district Shibuya beginnen zich abnormale gebeurtenissen voor te doen, waaronder mysterieuze sterfgevallen.
De gebeurtenissen draaien om agent Mo'taz die de opdracht krijgt om plotselinge, frequente brandgevallen in een lokale buurt te onderzoeken. Daar krijgt hij ruzie met de tovenaar Shams, waarna zijn leven van kwaad tot erger gaat.