Een politiechef neemt een jong kind op dat ze vindt in de buurt van de plek van een mysterieus ongeval dat geen herinnering heeft aan wat er is gebeurd. Het onderzoek brengt haar in een samenzwering die groter is dan ze ooit had gedacht, en de identiteit van het kind staat in het middelpunt van dit alles.
Twee moorden verbrijzelen een toch al verdeelde gemeenschap, wat leidt tot een van de grootste klopjachten in de Britse geschiedenis, terwijl de historische verdeeldheid, ontstaan tijdens de Mijnwerkersstaking drie decennia eerder, dreigt te worden aangewakkerd.
Het verhaal van een man genaamd Yook Dong-sik die toevallig getuige is van een moord en het dagboek van de moordenaar oppakt. Terwijl hij het toneel ontvlucht, krijgt hij een auto-ongeluk waardoor hij zijn geheugen verliest. Vanwege het dagboek dat hij in zijn bezit heeft, denkt hij ten onrechte dat hij een psychopathische seriemoordenaar is.
Volgt dominee Jack Brooks en haar dochter in Chapel Croft, een plek voor een nieuwe start die al snel de duistere geschiedenis van de gemeenschap onthult en waar eeuwenoud bijgeloof en wantrouwen jegens buitenstaanders heel gewoon zijn.
Alles aan het kleine stadje Beacon Heights lijkt perfect, van hun hoog gewaardeerde school tot hun overijverige inwoners. Maar niets in Beacon Heights is zoals het lijkt. De stress om perfect te zijn leidt tot de eerste moord in het stadje. Achter elke perfectionist schuilt een geheim, een leugen en een benodigd alibi.
Een onopvallende paranormaal begaafde uit de middelbare school confronteert een organisatie die plannen heeft om andere paranormaal begaafden te gebruiken om de wereld te regeren. Gebaseerd op de succesvolle manga.
Het verhaal draait om een eerstejaars middelbare scholier, Teiichi Niiya, die zich net had ingeschreven aan de Seikyou Private Academy. Wanneer hij verdwaalt in een van de oude schoolgebouwen, ontmoet hij een meisje genaamd Yuuko Kanoe, die zichzelf openbaart als een geest zonder herinneringen. Teiichi besluit vervolgens haar dood te onderzoeken door samen met Kirie Kanoe, Yuuko's familielid, en de onbewuste tweedejaars Momoe Okonogi diep in de beruchte Zeven Mysteries van de legendarische school te duiken. Door het hele verhaal heen ontdekken Teiichi en Yuuko de waarheid over deze spookverhalen en helpen ze degenen die in de problemen zitten, terwijl ze steeds dichter bij de waarheid achter Yuuko's dood komen.
