Na het succes in de Camelot Singularity worden Ritsuka Fujimaru en Mash Kyrielight toegewezen aan de laatste Singularity in het Grand Order-initiatief. In het oude Babylonië, 2500 v.Chr., beginnen ze aan een missie om het voortbestaan van de mensheid veilig te stellen. Bij aankomst vernemen ze dat drie goden Uruk hebben bedreigd, de Babylonische stad geregeerd door koning Gilgamesj. Ritsuka en Mash moeten samenwerken om de invasie van mysterieuze beesten in Uruk af te weren onder bevel van Gilgamesj, terwijl ze de ware aard van de acties van de drie goden tegen de mensheid onderzoeken; maar onbekend bij Ritsuka, ontwaakt een oude entiteit langzaam uit zijn slaap.
De natuur heeft Ash Lynx mooi gemaakt; opvoeding maakte hem tot een koude, meedogenloze moordenaar. Ash, een wegloper die is opgevoed als de geadopteerde erfgenaam en seksspeeltje van 'Papa' Dino Golzine, verlaat nu op de rebelse leeftijd van zeventien het koninkrijk dat wordt beheerd door de duivel die hem heeft grootgebracht. Maar het afschuwelijke geheim dat Ash's oudere broer in Irak gek maakte, is plotseling in papa's onverzadigbaar ambitieuze handen gevallen - en het is precies het verkeerde moment voor Eiji Okamura, een oprechte jonge fotograaf uit Japan, om kennis te maken met Ash Lynx.
Sherlock Holmes staat voor een serieus dilemma wanneer een crimineel syndicaat zijn beste vrienden, Dr. Watson en Mrs. Hudson, gijzelt. Tegelijkertijd verschijnt de mysterieuze Amerikaanse Amelia op zijn stoep.
In een klein stadje in het noorden van Mexico, waar twee drugskartels de macht hebben, omarmt de jonge man Lupe zijn gevaarlijke lot. Hij verandert in Coyotl, een mythisch wezen dat voor de helft mens en voor de helft beest is. Met deze transformatie wil Lupe de beschermer worden die zijn volk zo hard nodig heeft.
