De overblijfselen van een eeuwenoude beschaving op aarde bezitten gevaarlijke krachten. Het is aan de Spriggan-agenten van ARCAM Corporation om ze uit de verkeerde handen te houden.
Inspector Gadget en zijn nichtje Penny strijden nog altijd tegen de slechterik Dr. Claw. Sinds kort wordt het duo versterkt door de Gadgetinis. De groep heeft de missie alle snode plannen van Dr. Claw te dwarsbomen en de wereld te behoeden voor het gevaar.
Megatron neemt drastische maatregelen om de Decepticons te redden. Ondertussen vechten de Autobots op de planeet en aan boord van de Ark om heel Cybertron te redden.
De schorsing van de voorzitter van de studentenraad, Toyotomi Hideyoshi, heeft een machtsvacuüm gecreëerd op de Basara Academy. Nu strijden Date Masamune en Sanada Yukimura om de eerste plaats. Maar zij zijn niet de enigen die hun ogen op de prijs gericht hebben.
